Любые обособленные определения в виде словосочетания или отдельных слов выделяются запятыми с одной или с двух сторон (внутри предложения), если:

• относятся к личному местоимению,
• стоят после определимого существительного,
• стоят перед определяемым существительным, но имеют дополнительное значение причины см. п.7.3.

Приложения на письме выделяются запятой или двумя запятыми внутри предложения, если:

• относятся к личному местоимению,
• являются распространёнными и находятся после существительного,
• находятся перед существительным, но имеют добавочное значение причины,
• присоединятся союзом как, равным по значению будучи.

Приложение выделяется одним или двумя тире (внутри предложения), если оно распространенное и имеет оттенок самостоятельного сообщения.

Обособленные обстоятельства, выраженные деепричастным оборотом, выделяются:

• одной запятой, если находятся в начале или в конце предложения,
• двумя запятыми внутри предложения.

Не обособляются:

• фразеологизмы, в состав которых входят деепричастия (затаив дыхание, сложа руки и т.п.),
• наречия, образованные от деепричастий (дыша, стоя, нехотя, молча т.п.). см. п.7.4.

Выделяются запятыми с одной стороны или с двух сторон (внутри предложения): 1) обособленные одиночные и распространенные дополнения с предлогами кроме, согласно, вопреки, благодаря, ввиду, в случае, при отступлении, по причине; 2) уточняющие обстоятельства, которые присоединяются: а) без союзов, б) союзами то есть, или (в значении то есть), в) словами даже, особенно, например, в том числе, главным образом, в частности и др.

Например:

1. Кроме чаек, в море никого не было (М. Горький).

 Детям, по причине малолетства, не определили никаких должностей (И.С. Тургенев).

2. В Крыму, в Мисхоре, прошлым летом я сделал изумительное открытие (А.И. Куприн).

 Мы доехали на своих лошадях в возке, то есть в крытой рогожею повозке (С.Т. Аксаков).

 Кольчатый тюлень, или нерпа, относится к числу ластногих (В.К. Арсеньев)